In einem Auftrag von einem mysteriösen Mann werden Kogoro, Conan und die anderen nach Yokohama gerufen. Doch das Ganze ist eine Falle und Ran sowie die Detective Boys werden als Geiseln genommen. Die Zeit läuft: In 12 Stunden muss der Fall in dem Auftrag gelöst werden. Falls nicht, werden die Bomben, die bei Ran und den anderen installiert wurden, explodieren. Der Auftraggeber weiß auch noch um die wahre Identität von Conan als Shinichi Kudo! Der Detektiv des Westens, Heiji Hattori, und der Meisterdieb Kaito Kid treten ebenfalls auf den Plan. Aber Stunde für Stunde rückt das Zeitlimit näher! Wird es Conan und den anderen gelingen, den Schlüssel zu dem Fall rechtzeitig zu finden und so Ran und die anderen in Sicherheit zu bringen? Und wer ist der Kopf hinter dem rätselhaften Auftrag? Welche wahre Gestalt hat dieser dunkle Schatten...